LiSyM-Krebs besteht aus den drei Teilprojekten - SMART-NAFLD, C-TIP-HCC und DEEP-HCC sowie dem Programm- und Datenmanagement. Diese drei Projekte verwenden einen integrativen systemmedizinischen Ansatz, bei dem die Kommunikation der Leberzellen, der Stoffwechsel und die Signaltransduktion sowie die Dynamik der verschiedenen Leberzellpopulationen und die Zusammensetzung der extrazellulären Matrix untersucht werden. Dazu werden multi- und räumlich aufgelöste-OMICS und bildgebende Verfahren verwendet. Auf der Grundlage quantitativer Daten entwickeln Mathematiker und Bioinformatiker Modelle, die eine frühzeitige Erkennung von Veränderungen (Kipppunkte, Engl.: Tipping Points) ermöglichen, die die Entstehung von Leberkrebs begünstigen. Obwohl die meisten Fälle von Leberkrebs derzeit auf der Grundlage einer Zirrhose entstehen (Kipppunkt 2), gewinnt aufgrund der raschen Zunahme übergewichtiger und fettleibiger Patienten mit Fettlebererkrankungen der erste Kipppunkt zunehmend an Bedeutung.

Die drei Projekte in LiSyM-Krebs: SMART-NAFLD charakterisiert den Übergang von NAFLD direkt zum Leberkrebs (hepatozelluläres Karzinom, HCC) (Kipppunkt 1), C-TIP-HCC untersucht den Übergang von Leberzirrhose zu HCC (Kipppunkt 2) und DEEP-HCC liefert eine multidimensionale Charakterisierung des frühen HCC.

LiSyM-Krebs befasst sich darüber hinaus mit den folgenden Fragen:

1. Was sind die Ähnlichkeiten und Unterschiede bei Leberkarzinomen, die bei Patienten mit Fettlebererkrankung ohne Zirrhose auftreten, im Vergleich zu denen, die sich bei Patienten mit Leberzirrhose entwickeln?
2. Welche Faktoren oder Mechanismen erklären, dass Männer signifikant häufiger an Leberkrebs erkranken als Frauen?
3. Welche Bestandteile im Blut spiegeln ein Überschreiten der Kipppunkte für die Leberkrebsentstehung wider und könnten als Biomarker zur Früherkennung verwendet werden?
4. Welche Parameter der Kipppunktüberschreitung könnten als Zielstrukturen dienen, die die Entwicklung von HCC verhindern oder signifikant verzögern?

Wesentliches Ziel der Programmdirektion und des Programmmanagements ist es, eine netzwerkübergreifende konsortiale Zusammenarbeit zu ermöglichen und zu unterstützen und Synergien zu vermitteln, damit die Meilensteine der einzelnen Netzwerke und des gesamten Konsortiums erfolgreich erreicht werden können. Ein vertrauensvoller Datenaustausch, der den datenschutzrechtlichen Bestimmungen entspricht und durch ein zentrales, übergeordnetes Datenmanagementsystem ermöglicht und organisiert wird, ist unabdingbar.

Die Datenachritektur verwendet folgende Systeme: FAIRDOM SEEK für den Austausch wissenschaftlicher Daten und Publikationen, die Open Source NextCloud für den schnellen Austausch von semi-strukturierten Big Data, OMERO foder den Austausch von Bilddaten, openBIS für den labornahen Austausch von Daten und Metadaten und REDCap für Patientendaten.